jueves, 30 de octubre de 2014

La fiesta del año

Para esta entrada teníamos de consigna redactar un texto con todo lo aprendido durante este año en la materia bioquímica. Se nos ocurrió que podríamos relatar lo aprendido a través de una analogía, que es una manera entretenida de entender muchos temas que aprendimos a utilizar gracias a que Pablo (nuestro profe) nos incentivó a elaborar con distintas temáticas bioquímicas.
A principio de año un organizador de eventos divertidos y educativos (nuestro profe de bioquímica) decidió armar una fiesta que durara todo el año en un boliche llamado Escuela Agropecuaria con todos los alumnos de 4to. A esta fiesta se le fueron sumando distintos invitados especiales.
Al principio se sumaron las proteínas (macromoléculas muy importantes para el desarrollo de los seres vivos), de las cuales las más copadas eran las enzimas que nos explicaron que disminuían la energía de activación para poder catalizar las reacciones que sucedían en nuestro organismo. Les pareció tan buena la fiesta que invitaron a sus primos los hidratos de carbono que se vinieron con los lípidos (ambas macromoléculas también super importantes para los seres vivos).
Casi a mitad de año nos faltaba la energía de tanto bailar así que mientras descansábamos un poco, el organizador nos contó algunas cosas sobre la bioenergética y como se relacionaba con la termodinámica y así aprendimos las primeras dos leyes de la segunda (Ley de la conservación de la energía y Ley de la disipación) y las cuatro funciones de estado de la primera (entalpía, entropía, energía libre de Gibbs, energía libre de Gibbs estándar).
Después cayeron los colgados de los ácidos nucleicos, que se replicaron, trascribieron y tradujeron por toda la pista.
Luego de tanta entrada y salida de invitados y tanto baile va y baile viene, todos estábamos agotados de nuevo. Así que al organizador se le ocurrió la idea de incluir en la fiesta muchos chocolates que nos repongan la energía y además que ayuden a nuestras neuronas a funcionar con la glucosa que estos nos proveen así podíamos seguir incorporando nuevos conocimientos.
Y así lo hicimos ya que aprendimos las distintas vías metabólicas a las cuales podía ir a parar toda esa glucosa de los chocolates mientras los comíamos (glucogenogénesis, pentosa-fosfato, glucogenolisis, gluconeogénesis).

Como si fuera poco se presentó en la fiesta una banda llamada Respiración Celular que tocó sus tres mayores hits: la descarboxilación oxidativa del piruvato, el ciclo de Krebs y la cadena respiratoria, el cual nos fue cantado en dos idiomas (primero en castellano y después en inglés)

El crucigrama del año


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  1. Fotosíntesis: Proceso metabólico específica de ciertas células de los organismos autótrofos, por el que se sintetizan sustancias orgánicas a partir de otras inorgánicas, utilizando la energía luminosa.
  2. Chocolate: Golosina rica en glucosa que utilizamos en una clase de bioquímica para darle energía a nuestras neuronas para poder comprender todas las vías metabólicas que la glucosa que estábamos consumiendo podía transitar.
  3. Lípidos: Cada uno de los compuestos orgánicos que resultan de la esterificación de alcoholes con ácidos grasos.
  4. Piruvato: es un compuesto muy importante para la célula ya que es un sustrato clave para la producción de energía y de la síntesis de glucosa; que además es producto de la glucólisis, la deshidrogenación del lactato y la ruptura de ciertos aminoácidos glucogénicos.
  5. Punto isoeléctrico: este está definido como el pH en el cual las cargas positivas igualan a las cargas negativas y no existe un movimiento en el campo eléctrico.
  6. Catabólica: clasificación de una vía metabólica de degradación, en la cual las moléculas grandes, que proceden de los alimentos o de las propias reservas del organismo, se transforman en otras más pequeñas
  7. Krebs: Sir Hans Adolf fue un bioquímico alemán, ganador del Premio Nobel de Fisiología o Medicina en el año 1953. Descubrió que todas las reacciones conocidas dentro de las células estaban relacionadas entre sí, nombrando a esta sucesión de reacciones ciclo del ácido cítrico (1937), más tarde conocido como ciclo de Krebs. Estos estudios le valieron para ganar el Premio Nobel.
  8. Respiratory chain: this is the central theme we learnt about in the english class we had about biochemistry.
  9. Coenzimas: Componente orgánico no proteínico de una enzima, que interviene en la reacción catalizada por esta.
  10. Biochemistry: We had an english class in which we learnt about many things of this subject
  11. Enzimas: Proteína que cataliza específicamente cada una de las reacciones bioquímicas del metabolismo.
  12. Desoxirribosa: Aldopentosa derivada de la ribosa, que participa en la estructura de los ácidos desoxirribonucleicos.
  13. Ácidos grasos: Cada uno de los ácidos orgánicos monocarboxílicos, generalmente con un número elevado de átomos de carbono. Se combinan con la glicerina para formar las grasas.
  14. Metabolismo: Conjunto de reacciones químicas que efectúan constantemente las células de los seres vivos con el fin de sintetizar sustancias complejas a partir de otras más simples, o degradar aquellas para obtener estas.
  15. Aminoácidos: Sustancia química orgánica en cuya composición molecular entran un grupo amino y otro carboxilo. 20 de tales sustancias son los componentes fundamentales de las proteínas.

jueves, 16 de octubre de 2014

Draw my respiratory chain

Después de grabaciones fallidas, numerosas tomas y risas; hemos logrado, a través de nuestros pobres conocimientos en edición, realizar un video casero un tanto largo, sobre la cadena respiratoria.


Esperamos que les sea de ayuda para entender esta vía.

domingo, 12 de octubre de 2014

Ciclo de Krebs :)

Bueno acá les dejamos un video que nos pareció muy ingenioso y divertido que muestra todas las transformaciones de los intermediarios del ciclo de Krebs dentro del mismo.Ojalá les guste y divierta tanto como a nosotras y les resulte igual de educativo :)


jueves, 9 de octubre de 2014

Ciclo de Krebs y listas de casamiento

Con esta entrada nos proponemos explicar el ciclo de Krebs a través de un “cuento” analógico, si bien no se pueden explicar todas las características de este a través del mismo, esperamos que la comparación ayude a comprender esta vía.
Prosigamos a imaginarnos que una pareja desea casarse (una pareja muy inestable e impulsiva, que constantemente se pelea y reconcilia y cada vez que se reconcilia hace planes de casarse ya que esta analogía pretende representar un ciclo que se repite). El novio hace su lista de invitados con la ubicación en las mesas por su parte y la novia hace lo mismo por la suya. Estas listas con la ubicación representan respectivamente el oxalacetato y el acetilCoA.
La wedding planner (citrato sintasa) hace a los novios unir las listas así puede hacerse una idea de cuántas personas van a concurrir a la fiesta, dando lugar a una nueva lista (citrato).
Una amiga de la pareja (aconitasa) convence a los novios que cambien la ubicación de ciertos invitados, los cuales no se llevaban bien, y de esta manera evitar peleas. Así se modifica la lista con ubicaciones dando lugar a otra (isocitrato).
La novia (isocitrato deshidrogenasa), decide sacar a dos de sus primas que no soporta (hidrógenos) por lo que recorta la lista y le da los papeles con los nombres a su hija (NAD), que la estaba ayudando, para que los tire. Además decide sacar a los tíos abuelos del novio y su respectiva hija (CO2) a los cuales ni ella ni él tienen mucho aprecio. Así queda como resultado otra lista (alfa cetoglutarato).
Esa tarde, el novio revisa la lista y le pide consejo a sus tres mejores amigos de toda la vida (complejo alfa cetoglutarato deshidrogenasa), estos recortan a otros dos primos que el novio no soporta (hidrógenos) y le dan los papelitos a la hija de la pareja (NAD) que estaba jugando por ahí, para que los tire. Además sacan a los tíos abuelos de la novia con su respectiva hija también (CO2) y agregan a la novia de uno de ellos, ya que recientemente se reconciliaron (CoA). Quedando así otra lista (Succinil-CoA).
Unos días antes del casamiento, los novios deciden invitar a una pareja que habían conocido en un viaje hace un tiempo (GDP), entonces le piden a la hermana de la novia (Succinil-Co-A sintetasa) que vivía cerca de la casa de la pareja que les alcance la invitación. Mientras la hermana hablaba con la pareja, la mujer (que estaba embarazada) rompe bolsa y da a luz a su hijo (el cual representa la fosforilación que se le agrega al GDP, dando lugar al GTP). Luego, llama a los novios agradeciendo la invitación pero les avisa que no podrán asistir.
Esto junto con otros pequeños cambios que hace la hermana dan lugar a otra nueva lista (Succinato).
Más tarde, la suegra del novio (Succinato deshidrogenasa) se puso a revisar la lista y sin que nadie se de cuenta recortó a otras dos de las primas de la novia que no le agradaban (hidrógenos) y le dio los papelitos a su nieto (FAD) para que los tirara, quedando así como resultado otra lista (Fumarato).
El novio (fumarasa) incluye en la lista a su jefe, que asiste a la fiesta acompañado de sus dos hijas (H2O). Así, nuevamente, este cambio da lugar a otra lista (Malato).
La madrina del casamiento (malato deshidrogenasa), antes que se entregue la lista definitiva a la wedding planner, decide recortar dos primas del novio (hidrógenos), las cuales le habían avisado que no podrían concurrir, una vez recortadas le entrega los papelitos a la hija de los novios (NAD) para que los tire.
Con este último cambio, queda definida la lista del casamiento, que resulta ser la misma lista que confeccionó el novio en un principio (oxalacetato).

Debe destacarse, que la wedding planner debido a los repetidos cambios en la lista, que nunca terminaban de definir, sufrió un fuerte ataque de estrés durante toda la analogía de esta vía.

jueves, 2 de octubre de 2014

Chocolates bioquímicos

El día 26/9 en #Bioquímica realizamos una clase de #QuímicaConChocolates (en la cual todos aquellos que alguna vez llegaron tarde al aula debían traer un chocolate para compartir) y  exposiciones orales para aprender más sobre las vías metabólicas de hidratos de carbono que actúan en nuestro organismo. Es así que mientras todos disfrutábamos del dulce chocolate, aprendíamos la importancia de la glucosa (la cual es fundamental para el funcionamiento de  nuestras neuronas y eritrocitos así como para el músculo esquelético en anaerobiosis) y todas las vías metabólicas que esta puede transitar.

Aprendimos sobre cuatro de estas a través de entretenidas e ingeniosas presentaciones que nuestros compañeros realizaron. Estas vías fueron glucogenogénesis (http://flashbioquimico.blogspot.com.ar/ y http://quimicos2-0.blogspot.com.ar/) , pentosa-fosfato (http://mundobioquimica4b.blogspot.com.ar/), glucogenolisis (http://somosquimicaiii.blogspot.com.ar/ y http://untoquedebioquimica.blogspot.com.ar/)  y gluconeogénesis (la cual está explicada en una de nuestras entradas previas y en http://bioquimicaexplosiva.blogspot.com.ar/). Los invitamos a que vean los links de nuestros compañeros y se enteren con lujo de detalle de que trata y cómo funciona cada ruta metabólica.


jueves, 11 de septiembre de 2014

Gluconeogénesis

La gluconeogénesis es una ruta metabólica anabólica que permite la biosíntesis de glucosa a partir de precursores no glucídicos. Incluye la utilización de varios aminoácidos, lactato, piruvato, glicerol y cualquiera de los intermediarios del ciclo de los ácidos tricarboxílicos como fuentes de carbono para la via metabólica. Se la puede clasificar como lineal, anabólica, endergónica, reductora, consumidora de ATP. El objetivo de esta vía es biosintetizar glucosa y glucógeno a partir de fuentes no glucocídicas. En humanos, el hígado y el riñón son los principales órganos gluconeogénicos. Dentro de la célula, las reacciones necesarias para obtener malato a partir de piruvato se realizan en la mitocondria, pero el resto de la gluconeogénesis se realiza en el citosol. 
El balance energético:


  • Si se parte de dos moléculas de lactato o piruvato sería -6ATP ya que en la etapa de piruvato carboxilasa se "invierten" 2ATP; en la de fosfoenolpiruvato carboxiquinasa, 2GTP; y en la de fosfoglicerato quinasa, otros 2ATP.
  • Si se parte de dos oxaloacetatos sería -4ATP ya que en la etapa de fosfoenolpiruvato carboxiquinasa se "invierten" 2GTP y en la de fosfoglicerato quinasa, otros 2ATP.
  • Si se parte de dos gliceroles sería -2ATP ya que solo en la etapa de glicerolquinasa se "invierten" 2ATP

En cuanto al sustrato, la participación del oxaloacetato en las dos primeras reacciones de esta vía conecta la gluconeogénesis con el ciclo de Krebs. Como todo intermediario del ciclo se convierte en oxaloacetato a través del ciclo de ácido cítrico, cualquiera de esos intermediarios y todo compuesto capaz de transformarse en uno de ellos puede ser precursor de la glucosa.  También el glicerol puede ser un sustrato de la glucosa. Con respecto al producto que se genera es la  glucosa o el glucógeno que tienen como destino todos los tejidos que requieran esta nueva glucosa sintetizada para obtener energía debido a una deficiente dieta en carbohidratos por ejemplo. 
La regulación de la gluconeogénesis puede ser génica pero más que nada es alostérica. Las enzimas que se regulan son la piruvato carboxilasa, la fosfoenolpiruvato carboxiquinasa y la fructosa-1,6-bisP fosfatasa. La primera es estimulada por la presencia de acetilCoA y se inhibe ante la presencia de ADP, la seguda es inhibida por la presencia de ADP mientras que la tercera es inhibida por la presencia de AMP y Fructosa 2,6 biP y es estimulada por la presencia de citrato.



La principal coenzima que es necesaria para esta vía es NADH+H (NAD reducido), pero existen otras que pueden intervenir como la Biotina. El factor limitante es el NADH+H. 
Por último, según cual sea el sustrato de la vía, esta puede presentar 3 ecuaciones globales:
Si son dos piruvatos:
2 Piruvato + 4 ATP + 2 GTP + 2 NADH + 6 H2O --> Glucosa + 4 ADP + 2 GDP + 6 Pi + 2 NAD
Si son dos oxaloacetatos:
2 oxaloacetatos+2GTP+2ATP+6H2O+2NADH-->Glucosa+2GDP+2ADP+6Pi+2NAD
Si son dos gliceroles:
2gliceroles+2ATP+4H2O-->Glucosa+2ADP+4Pi